Mặc dù bị ảnh hưởng của dịch SARS, Nhà hát múa rối Thăng Long vẫn đảm bảo đủ số buổi biểu diễn tại rạp là 1 036 buổi và 80 buổi biểu diễn tại 1 số quốc gia như: Hy Lạp, Tây Ban Nha. Đặc biệt trong Hội diễn múa rối toàn quốc 2003, ba chương trình rối cạn: Tiếng gọi trẻ thơ, Bù nhìn rơm, Múa chim công đã được Nhà hát dàn dựng kịp thời thay cho vở Chuyện lạ chốn cung đình để tham dự. Tác giả và đạo diễn Lê Văn Ngọ được tặng HCV tiết mục Tiếng gọi trẻ thơ, tập thể nghệ sỹ Nhà hát được tặng 1 HCV cho tiết mục Chim công. Ngoài thành công đó, Nhà hát đã tham dự hhững ngày văn hoá Tây Nguyên, đến biểu diễn ở vùng sâu vùng xa các tỉnh Đắclắc, Lâm Đồng, Gia Lai, Playku. Trong năm 2003, Nhà hát múa rối Thăng Long là một đơn vị nghệ thuật hoạt động có hiệu quả với doanh thu 6.5 tỷ đồng.
